Гуманитарное разминирование традиционно ассоциируется с сушей, но водные пространства не менее уязвимы из‑за неразорвавшихся боеприпасов и мин после боевых действий.
Опасные объекты могут находиться на дне, в прибрежной полосе и на подводных объектах и представлять собой мины, бомбы, снаряды и иные ВОП, угрожающие судоходству, гидротехническим работам и природной среде.
Поэтому очистка акватории от взрывоопасных предметов становится приоритетной задачей гуманитарного разминирования и охраны морской среды.

Для очистки водных акваторий используют комплекс методов, учитывающий глубину, рельеф дна и гидрологические условия.
Геофизические исследования: применяются магнитометры, гидролокаторы бокового обзора, сонары и эхолоты для поиска и картирования потенциально опасных объектов.
Специальные тралы и сети: используются для выборочного вылова мин и других ВОП из толщи воды и приповерхностных слоев дна.
Подводные роботы: телеуправляемые аппараты с камерами и манипуляторами позволяют обнаруживать, идентифицировать и готовить ВОП к уничтожению или подъему.
Водолазные работы: водолазы проводят детальный осмотр и разминирование с применением подводного оборудования и средств защиты.
Нейтрализация: подводный подрыв, разрушение корпуса, гидроакустическое воздействие или иные методы, подбираемые с учетом глубины, типа боеприпаса и экологических ограничений.
Перед началом операций специалисты анализируют глубину, прозрачность воды, тип грунта и другие параметры акватории, чтобы выбрать наиболее безопасный и эффективный сценарий работ.
Ключевым этапом является обнаружение и точная локализация ВОП с помощью магнитометрии, гидролокации и активных акустических средств.
По результатам обследования формируют карту целей, после чего подводные роботы или водолазы выполняют идентификацию и подготовку объектов к разминированию.

Дальнейшее обезвреживание может включать подводный подрыв, подъем с последующей утилизацией или применение специальных систем, например импульсных водоструйных установок на специализированных судах.
Все операции проводятся с учетом минимизации влияния на морскую флору и фауну.
Неразорвавшиеся боеприпасы в морской среде со временем корродируют, выделяя токсичные компоненты, которые наносят вред морским организмам и загрязняют воду.
Непредвиденные взрывы способны разрушить подводные экосистемы и создать угрозу для рыбаков, рабочих на прибрежных объектах и экипажей судов.
Очистка акваторий в рамках гуманитарного разминирования спасает жизни, снижает долгосрочные экологические риски и открывает возможности безопасного использования водных ресурсов в экономике и сельском хозяйстве.
Для этого задействуются специализированные суда, робототехника и современные методы гидроакустической и магнитной съемки.